在開工時先用新鮮空氣代替有機廢氣，借燃燒器將蓄熱室加熱到一定溫度。由于蓄熱體具有極高的儲熱性能，所以從一個冷的RTO加熱到800?850℃,并且還要達到正常的溫度分布，一般要經過幾天時間（目前也有縮短到以小時計）。

　　廢氣冶理在正常操作時，比如蓄熱室A已在前一個操作循環（或稱周期）中存儲了熱量，有機廢氣首先從底部進人蓄熱室A，廢氣通過蓄熱體床層被預熱到接近燃燒室溫度，而蓄熱體同時逐漸被冷卻；接著，預熱后的廢氣進人頂部燃燒室（即主反應區，氣體在燃燒室中的停留時間約為1s)，在燃燒室中有機化合物被氧化后，即作為高溫凈化氣進人蓄熱室 B；此時，凈化氣將熱量傳給蓄熱體，蓄熱體床層逐漸被加熱，而凈化氣則被冷卻后排出。當蓄熱室A冷卻到尚可允許的溫度水平時，就應切換氣流的流向，即完成第1個循環。切換流向后，有機廢氣進入已被加熱過的蓄熱室B，反應后的凈化氣則將熱量傳給已冷卻的蓄熱室A，如上所述一樣，完成第2個循環。這樣通過不斷反復循環操作來實現廢氣的凈化和熱量的充分利用。一個循環時間，即切換時間大約為30?120s (兩個切換時間就是一個全周期時間）。如果廢氣中可燃物濃度達到自供熱操作的水平，那么燃燒器只需在開工時使用，在正常運轉時可以關閉。

　　若對有機廢氣的凈化率要求很高，則可采用兩種方法：一種是延長循環時間的操作方法，但這樣會使熱效率降低；另一種常用的方法是增加一臺沖洗用蓄熱室， 即采用三室RTO裝置。